En el select.def, dale un numero orden a tu jefe y sub-jefe. Si por ejemplo, el sub-jefe fuera 2 y el jefe fuera 3, deberias escribirlo como:
subjefe, order=2
kfm, order=3
Checa que es en order=x donde puedes asignar el valor de x, de 1 a 10, el cual dice el numero de orden que tiene el personaje.
Por ultimo, checa la parte [Options] que viene en el select.def, usualmente al final:
;---------------------------------------------------------------------
[Options]
;Here you set the maximum number of matches to fight before game ends
;in Arcade Mode. The first number is the number of matches against
;characters with order=1, followed by order=2 and order=3 respectively.
;For example, for 4,3,1 you will fight up to 4 randomly-picked
;characters who have order=1, followed by 3 with order=2 and 1 with
;order=3.
arcade.maxmatches = 6,1,1,0,0,0,0,0,0,0
;Maximum number of matches to fight before game ends in Team Mode.
;Like arcade.maxmatches, but applies to Team Battle.
team.maxmatches = 4,1,1,0,0,0,0,0,0,0
Aqui modifica el numero de matches deseados. En el ejemplo anterior, lucharas contra 6 personajes normales, 1 sub-jefe y un jefe, en el modo Arcade y en el modo Team.
Espero te sea de ayuda, saludos.