nesecitas 2 programas:
-FighterFactory
-Paint
1-con el Paint pasa las imagenes a formato png, si el tuyo es de los que lee pcx es mejor hacerlos con ese formato pero casi nadie lo tiene XD.
2-con el fighter factory vas a sprites, pones abrir (open), vas a la carpeta data de tu mugen, seleccionas el archivo system.sff
3-vas a estar en las imagenes del screenpack, al lado del disquet que dice pcx, hay una carpeta que dice cambiar (change) o pcx, no me acuerdo, haces clic en ella, te va a salir una ventana en la que sale el formato, elige entre pcx o png (el bmp no me funciona a mi XD), y cambias las imagenes, espero haberte ayudado